Le Partenariat étant la plus grande plateforme multi-acteur de lutte contre le paludisme, il est idéalement placé pour travailler dans les différents secteurs et régions, tant au niveau national que mondial, en suivant le principe « accomplir davantage, ensemble », en évitant la duplication et la fragmentation des activités et en assurant une utilisation optimale des ressources. Son principal rôle est d’harmoniser les initiatives et d’aider les pays touchés par le paludisme, les donateurs et les partenaires à atteindre les objectifs convenus en matière de lutte et d’élimination du paludisme.